Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 CHIAP2-204ENST00000532686 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC245748.2-201ENST00000588655 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRHP20396 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRHP20396 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRHP20396 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRHP20396 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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