Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms