Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GLI4P10075 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GLI4P10075 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms