Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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