Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms