Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KNCNA6PVL3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms