Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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