Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LYSTQ99698 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms