Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAM19A4Q96LR4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms