Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM208BQ5VWN6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms