Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms