Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms