Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NLRP12P59046 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms