Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms