Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLH1P40692 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MLH1P40692 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms