Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms