Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FGFR3P22607 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms