Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCB4P21439 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms