Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRM1P11229 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms