Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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