Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB4AP04350 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms