Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF879B4DU55 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms