Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
U3KQV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
U3KQV3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
U3KQV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
U3KQV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
U3KQV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
U3KQV3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
U3KQV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
U3KQV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
U3KQV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
U3KQV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
U3KQV3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms