Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A3GALT2U3KPV4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
A3GALT2U3KPV4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms