Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGEF1Q9Y6D6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms