Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX9Q9Y5X1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms