Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNPO3Q9Y5L0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms