Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPO11Q9Y5K1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPO11Q9Y5K1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms