Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB4Q9Y5E5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms