Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB1Q9Y478 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms