Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SF3B6Q9Y3B4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3B6Q9Y3B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3B6Q9Y3B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms