Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC1Q9Y3B2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms