Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COQ4Q9Y3A0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COQ4Q9Y3A0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms