Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG3Q9Y2Y8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms