Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NUDCQ9Y266 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUDCQ9Y266 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms