Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCAF8Q9UPN6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCAF8Q9UPN6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms