Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms