Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PARP4Q9UKK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms