Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO3Q9UK99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO3Q9UK99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO3Q9UK99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO3Q9UK99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO3Q9UK99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms