Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF11Q9UIL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms