Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF1Q9UH73 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms