Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF20Q9UGU0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF20Q9UGU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF20Q9UGU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF20Q9UGU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms