Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms