Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.7 ms