Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF8

PI4KB, Phosphatidylinositol 4-kinase beta, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KBQ9UBF8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KBQ9UBF8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KBQ9UBF8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KBQ9UBF8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PI4KBQ9UBF8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PI4KBQ9UBF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KBQ9UBF8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms