Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1AQ9UBC5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms