Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH4Q9P2E8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms