Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.12
CCDC180Q9P1Z9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC47■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC47■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.11
CCDC180Q9P1Z9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms