Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM9Q9P0T7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms