Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPAQ9P0L0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms